A redução no custo de amostragem
O tamanho extremamente diminuto do DNA contribui para a sua homogeneização e presença em volumes de amostra muito inferiores aos utilizados tradicionalmente: entre 1 e 10 g ao invés de kg. O DNA também está presente aderido ao material particulado em suspensão ou aderido a substratos artificiais, assim como dissolvido na própria água. Essas matrizes nos permitem imaginar estratégias de amostragem muito distintas das utilizadas atualmente, com grande redução de custo e aumento da representatividade, criando oportunidade para uma mudança radical no modelo de negócio das empresas que prestam serviços para a indústria.
Big data de indicadores ecológicos
A robustez da metodologia de metagenômica está no grande volume de dados analisados. Na prova de conceito realizada na bacia de Campos em 2014, foram identificadas mais de 1 milhão de unidades taxonômicas operacionais. As tecnologias de sequenciamento de DNA estão permitindo a biologia entrar na era da big data e a automatização do processo de análise, permite que esses resultados cheguem às mãos dos tomadores de decisão praticamente em tempo real.
Avaliação retroativa da biodiversidade
Como o DNA é altamente conservado, a metodologia permitiria ainda a avaliação retroativa da biodiversidade, com a extração em água ou sedimentos congelados e preservados em álcool ou formol em laboratórios e museus.