A genotipagem de mexilhões amostrados em cada geração produzida em laboratório será realizada para avaliação de métricas como frequência alélica, taxa de disseminação do construto CRISPR, surgimento de possíveis mutações de resistência, entre outras. A genotipagem pode envolver técnicas como extração de DNA, PCR, análise de curvas de dissociação, eletroforese, sequenciamento de DNA e análise de sequências com ferramentas de bioinformática.